Il fatto che l'aria sia così fredda da richiedere l'apertura di finetrini per non gelare mi fa pensare che ci sia qualcosa di fuori posto nella centralina di controllo del clima più che sull'impianto di produzone del freddo ( gruppo compressore ).
Da quanto ne so il condizionatore funziona con un compressore inverter come quello usato dai moderni frigoriferi o impianti clima domestici e quindi dovrebbe variare la potenza impegnata dal compressore i base al delta T da compensare, in nodo totalmente svincolato da quanto stan facendo i motori di trazione.
Il fatto che la tua compagna senta così freddo mi fa pensare o a un uso errato del clmatizzatore ( se lo tieni su LO ovviamente raffredderà come un dannato ) oppure a un guasto alla centtralina o alle sonde termiche. In tal caso potrebbe succhiare così tanta potenza alle batterie ( che per quanto tu possa aver fatto un ottimo lavoro di pulizia, avranno perso comunque un po' di efficienza ) da mandare in protezione il sistema.
Il compressore del clima ( visto che non c'è più il vincolo del collegamento alla cinghi servizi ) penso si trovi nella parte bassa della vettura in prossimità del radiatore. Dovrebbe esserci un cablaggio che parte dal gruppo inverter verso il motore del compressore.
Penso che occorra guardare da sotto con un ponte, probabilmente levando lo scudo inferiore.
In questo video attorno al minuto 8 viene mostrato l'impianto della Prius ma penso che non cambi molto per la Yaris
